1982 yılında Dünya'ya gelen uzaylılar, Güney Afrika'nın üzerinde beliren devasa uzay gemisinden çıkarak insanlarla temas kurar. Zamanla Johannesburg'un kenarında, "Bölge 9" adı verilen bir gettoya yerleştirilen bu yabancı varlıklar, insanlar tarafından dışlanır ve MNU adlı özel bir şirketin kontrolü altında yaşamaya zorlanır.
Şirket, uzaylı teknolojisinin sırlarını çözmek ve silah endüstrisinde kullanmak için her yolu dener.
MNU çalışanı Wikus van der Merwe, Bölge 9'da yürütülen bir operasyon sırasında gizemli bir uzaylı sıvısına maruz kalır.
Kısa sürede vücudu değişmeye başlayan Wikus, şirketin hedefi haline gelir. Artık hem insanlar hem de uzaylılar için bir tehdit olarak görülen Wikus, hayatta kalmak için tek çaresinin Bölge 9'daki uzaylılarla işbirliği yapmak olduğunu fark eder.
Kaçış mücadelesi verirken, uzaylılardan biri olan Christopher Johnson ile beklenmedik bir ittifak kuran Wikus, insanlığın ve uzaylıların kaderini değiştirecek bir sırrın peşine düşer. Ancak MNU ve diğer güçler, bu sırrı ele geçirmek için her şeyi yapmaya hazırdır.
