Sovereign, Jerry Kane'in hikâyesini anlatıyor. İşsiz bir çatı ustası olan Jerry, 15 yaşındaki oğlu Joe ile birlikte geçim derdine düşmüş, hayata tutunmaya çalışan bir bekar babadır.
Zorlu koşullar altında kontrolü eline almak isteyen Jerry, egemen vatandaş hareketine yakınlaşır ve oğluna yasaların birer yanılsamadan ibaret olduğunu, özgürlüğün ancak mücadeleyle kazanılabileceğini öğretir.
Jerry, ülke genelinde düzenlediği borç hafifletme seminerleri ile umutsuz ev sahiplerine umut satarken, inandığı fikirler giderek radikalleşir. Gerçeklikle arasındaki bağ zayıflarken, Joe ise sürekli yolculukların ötesinde sıradan bir hayatın hayalini kurmaya başlar.
Babasının öğretilerini içten içe sorgulayan Joe, kendi yolunu bulmaya çalışır.
Baba ile oğul arasındaki gerilim, Jerry'nin dünyaya bakışı sertleştikçe artar.
Joe'nun sessiz isyanı, ikilinin ilişkisini derinden sarsarken, Jerry'nin inandığı ideolojinin bedeli ağırlaşır.
