Şrek ve Eşek, Fiona'nın peşine düşen esrarengiz bir tehditle yüzleşir: Lord Farquaad'ın hayaleti, ölümün ötesinden dönerek intikam peşindedir. Karanlık gölgelerle çevrili bu mücadelede, üçlü hem korku dolu anlar yaşar hem de beklenmedik sırlarla karşılaşır.
Farquaad'ın hayaleti, Duloc Şatosu'nun derinliklerinden yükselirken, Şrek ve arkadaşları onun gerçek niyetini çözmeye çalışır. Fiona'nın tehlikede olduğunu fark eden ikili, zamana karşı yarışarak bu ürkütücü varlığı durdurmak zorundadır.
Gizem ve mizahın iç içe geçtiği bu macerada, Şrek her zamanki gibi cesaretiyle öne çıkar. Ancak bu kez düşman, geçmişin gölgesinden gelen bir tehdittir ve onu alt etmek için tüm becerilerini kullanması gerekecektir.
