Küçük balık Nemo, annesini kaybettikten sonra babası Marlin’in aşırı korumacı tavırlarıyla büyür. Babası, onu okyanusun tehlikelerinden korumak için sürekli uyarır, hatta açık denizlere yüzmesini bile yasaklar.
Ancak Nemo’nun merakı ve isyankâr ruhu, bir gün babasının sözlerini dinlemeyip uzaklara yüzmesine neden olur. Ne yazık ki bu macera, onu bir dalgıç tarafından yakalanıp bir akvaryuma götürülmek gibi beklenmedik bir sona sürükler.
Marlin, oğlunu kurtarmak için hiç bilmediği bir dünyaya adım atar. Yolculuğu sırasında unutkan ama neşeli bir balık olan Dory ile tanışır ve ikili, Nemo’nun peşine düşer.
Devasa deniz canlıları, tehlikeli akıntılar ve beklenmedik engellerle dolu bu yolculuk, Marlin’in korkularıyla yüzleşmesini sağlar. Oğluna ulaşmak için her şeyi göze alan baba, okyanusun derinliklerinde cesaretin ve sevginin gücünü keşfeder.
Bu sırada Nemo, akvaryumda yeni arkadaşlar edinir ve onların yardımıyla özgürlüğüne kavuşmak için bir plan yapar. Babasının kendisini aradığını bilmese de, içindeki umudu kaybetmez.
İki farklı macera, baba ile oğlunun birbirlerine olan bağını ve inanılmaz bir yolculuğun gücünü gözler önüne serer.
