Kremlin Sarayı'nın gizemli bir patlamayla yerle bir edilmesi, uluslararası bir krizi tetikler. Rusya, bu saldırının sorumlusu olarak Ethan Hunt ve IMF ekibini işaret ederek "Hayalet Protokolü"nü devreye sokar.
Tüm dünya tarafından aranan Hunt, suçsuz olduğunu kanıtlamak ve gerçek faili ortaya çıkarmak için yeni bir ekip kurmak zorunda kalır.
Hunt ve ekibi, nükleer savaş tehdidini önlemek için zamanla yarışırken, bir yandan da kendilerini kovalayan güçlerden kaçmak zorundadır.
Dubai'nin göz alıcı gökdelenlerinden Mumbai'nin labirent gibi sokaklarına uzanan tehlikeli bir kovalamaca başlar. Ekip, her adımda daha da derinleşen bir komplonun içinde kendini bulur.
Güvenilir hiçbir kaynağı kalmayan Hunt, sadece ekibinin becerilerine ve kendi zekasına güvenmek zorundadır. İmkansız görünen görevler, sürükleyici aksiyon sahneleri ve beklenmedik ihanetlerle dolu bu mücadelede, her şeyi riske atarak gerçeğin peşine düşer.
