Endonezya'nın gizemli sularında geçen Amphibious 3D, derinlerde yatan korkunç bir sırrı ortaya çıkaran bir korku-macera filmi. Deniz biyoloğu Skylar, araştırma ekibiyle birlikte bölgedeki balıkçı köylerinden gelen tuhaf kayıp haberlerini araştırırken, sudan çok daha tehlikeli bir şeyin peşlerinde olduğunu fark eder.
Ekip, efsanelerde bahsedilen devasa bir deniz canavarıyla karşı karşıya kalır. Köylülerin anlattığı kadim hikayelerin gerçek olduğunu anladıklarında, kaçış yolları teker teker kapanmaya başlar.
Suların altında saklanan yaratık, hem karada hem de denizde avını takip edebilmektedir.
Panik ve çaresizlik içindeki grup, canavarın kökenini çözmeye çalışırken hayatta kalmak için son bir mücadeleye girişir.
Ancak, gerçek tehdidin sadece yaratık olmadığını anladıklarında iş işten geçmiş olabilir.
