Yüzüklerin Efendisi: İki Kule, Yüzüğün Kardeşliği'nin devamı niteliğinde, Hobbitler Frodo Baggins ve Samwise Gamgee'nin Mordor'daki Hüküm Dağı'na yolculuklarını anlatıyor. Yol boyunca Gizemli Gollum adında bir yaratıkla karşılaşırlar.
Gollum bir zamanlar bir Hobbitti ancak yüzüğün gücüne yenilerek korkunç bir yaratığa dönüşmüştü. Hobbitleri Kara Kapılar'a götürmeyi teklif eder ancak Sam, Gollum'a güvenmez.
Frodo ise bir zamanlar kendisinin de bu yüzüğü taşıdığını hatırlayarak Gollum'a acıyarak teklifini kabul eder. Frodo, Sam ve Gollum, tehlikeli ormanlardan ve karlarla kaplı arazilerden geçerler.
Yolculukları sırasında Ork ordularıyla ve devasa bir örümcekle karşılaşırlar. Gollum'un ihanetine ve Sam'in şüphelerine rağmen Frodo, Yüzüğü Mordor'a taşıma görevine devam eder.
Aynı zamanda, Aragorn, Legolas ve Gimli, Merry ve Pippin'i kurtarmak için uzun ve zorlu bir yolculuğa çıkarlar. Rohan'ın Kralı Théoden'in yardımıyla, Nazgûl'leri yenerler ve Merry ve Pippin'i kurtarırlar.
Sonunda iki grup Helm's Deep'te yeniden bir araya gelirler. Ancak Rohan'ın ordusu, Saruman'ın devasa ordusunun kuşatması altındadır.
Aragorn, Legolas ve Gimli, Rohan'ın savunmasına yardım eder ve destansı bir savaş yaşanır. Frodo ve Sam ise yolculuklarına devam ederek Mordor'a doğru yola çıkarlar.
