Shrek ve Fiona, balayılarının keyfini çıkarırken beklenmedik bir davet alırlar: Fiona'nın ebeveynleri, Uzak Ülke'nin kralı ve kraliçesi, çifti saraylarında ağırlamak istemektedir. Yanlarına sadık arkadaşları Eşek'i de alarak yola koyulurlar.
Ancak Fiona'nın ailesi, kızlarının bir devle evlendiğini ve artık bir oğlana dönüşmüş olduğunu görünce şok yaşar.
Kral, kızının bu evliliğini kabullenmekte zorlanır çünkü onun için çok farklı planları vardır.
Peri Vaftiz Anne ve yakışıklı Prens Charming ile işbirliği yaparak Shrek ile Fiona'nın aşkını bozmaya karar verir. İşler karışırken, yolculuklarına ünlü bir kılıç ustası olan Çizmeli Kedi de katılır ve maceraya yeni bir renk katar.
Shrek, Fiona'nın kalbini kazanmak için mücadele ederken, ikilinin sevgisi bir kez daha sınanır. Uzak Ülke'deki bu kaotik durum, herkesin gerçek mutluluğun nerede olduğunu yeniden düşünmesine neden olur.
