Umbrella Şirketi'nin ölümcül T-virüsü artık Raccoon City'nin tüm sokaklarına yayılmış durumda. Şehir, aç kalmış zombi sürüleri ve mutasyona uğramış canavarlar tarafından istila edilmiş bir cehenneme dönüşmüştür.
Umbrella'nın deneyleri sonucu insanüstü yeteneklere sahip olan Alice, bu kaosun ortasında hayatta kalmaya çalışırken kaderin kendisine biçtiği rolü üstlenmek zorunda kalır.
Alice, virüsten etkilenmemiş bir grup hayatta kalanla birleşir.
Aralarında eski S.T.A.R.S. üyesi Jill Valentine ve tecrübeli asker Carlos Oliveira gibi donanımlı savaşçılar da bulunmaktadır.
Birlikte, şehri ele geçiren yaratıklara karşı amansız bir mücadeleye girişirler. Ancak asıl tehdit, Umbrella'nın şehre saldığı insan avcısı Nemesis adlı biyomekanik canavardır.
Kurtuluş umutları, Umbrella'nın bilim insanı Doktor Ashford'un teklifine bağlıdır. Ekip, doktorun kızını güvenli bir şekilde şehirden çıkarmayı başarırsa, kendileri de bu cehennemden kaçma şansı bulacaktır.
Zaman daralırken, hem ölümcül yaratıklarla hem de Nemesis'le yüzleşmek zorunda kalırlar.