Efsanevi dünyanın prensi Nuada, insanlığa karşı isyan başlatarak yeryüzünü ele geçirmeyi planlar. Nuada, durdurulamaz bir mekanik ordu olan Altın Ordu'yu uyandırmak için gereken parçaları toplamaya başlar.
Bu tehdidi engellemek için Hellboy ve ekibi, Prens Nuada'nın planlarını bozmak üzere harekete geçer.
Hellboy, Liz ve Abe'den oluşan ekip, Nuada'nın saldırılarını durdurmak ve Altın Ordu'nun kontrolünü ele geçirmesini engellemek için zorlu bir mücadeleye girişir.
Bu süreçte, Hellboy kendi kimliği ve insanlık arasındaki çatışmalarla yüzleşirken, ekip arkadaşlarıyla birlikte insanlığın kaderini belirleyecek bir savaşa atılır.
Altın Ordu'nun uyanışıyla birlikte, Hellboy ve ekibi, insanlığın yok oluşunu engellemek için hem fiziksel hem de duygusal sınırlarını zorlayacakları destansı bir maceraya atılır.
Bu mücadelede, dostluk, fedakârlık ve kahramanlık kavramları yeniden tanımlanırken, Hellboy'un kaderi de şekillenir.